On distingue six grandes catégories d’indications, à savoir, les maladies tumorales, infectieuses, inflammatoires, auto-immunes, allergiques, ainsi que les rejets de greffes. Cela concerne donc l’oncologie, l’hématologie, les maladies inflammatoires (dont bien entendu la rhumatologie), l’immunité, la neurologie, l’ophtalmologie, la pneumologie, la dermatologie et le cardiovasculaire.

Une même substance peut avoir plusieurs indications.

Exemples d’indications :

- Abatacept : polyarthrite rhumatoïde, arthrite juvénile idiopathique ;