Profondément enfouis sous le cortex, les ganglions de la base sont constitués d’un ensemble de noyaux très interconnectés : striatum, pallidum, noyau subthalamique et substance noire divisée en deux parties, réticulée et compacte regroupant les neurones dopaminergiques. Ils intègrent et traitent des informations venant de différentes parties du cortex avant de retourner des informations au cortex moteur. Ils jouent un rôle dans l’initiation et le bon déroulement de la commande motrice.