Les spécialités Nivaquine (100 mg comprimés et 25 mg/5 ml sirop) sont désormais contre-indiquées pendant l’allaitement et ne doivent pas être prescrites au cours de la grossesse, sauf en l'absence d'alternatives thérapeutiques plus sûres. De plus, une contraception efficace doit être mise en place chez les hommes et les femmes en âge de procréer, pendant le traitement et jusqu'à 8 mois après l'arrêt de celui-ci.