La durée d’incubation de l’infection reste inconnue car les signes cliniques apparaissent très progressivement : elle est estimée comprise entre 3 et 10 jours. Fédérées sous le nom de « fièvre Zika », les signes cliniques les plus fréquemment rapportés sont une fièvre légère, de la fatigue, des éruptions cutanées maculo-papuleuses, parfois extrêmement prurigineuses (au point d’empêcher le sommeil), des myalgies, des arthralgies des extrémités (poignets, chevilles, petites articulations des mains) et du dos et une conjonctivite non purulente.