D’une manière générale, la fréquence et l’intensité des effets indésirables sont moindres avec la voie intramusculaire qu’avec la voie sous-cutanée.
Les réactions locales, plus fréquentes avec les vaccins adsorbés sur hydroxyde d’aluminium, sont en général peu graves et de type inflammatoire : rougeur, œdème, induration, surtout lorsque l’on utilise une aiguille courte (injection proche du derme), mais aussi irritation locale, formation de granulome ou de nodule inflammatoire pouvant conduire à la constitution d’un abcès. Comme elles sont d’autant plus fréquentes et intenses que le vaccin est administré superficiellement, la voie IM profonde est recommandée.
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