L'articulation du genou est divisée en trois compartiments, et selon les parties concernées on distingue plusieurs types de gonarthrose. La gonarthrose fémoro-patellaire affecte le point de jonction du haut de l'articulation, situé entre le fémur et la rotule (ou patella). La gonarthrose fémoro-tibiale se situe au point de jonction entre le fémur et le tibia, elle peut être interne (localisée à la face interne du genou) ou externe (située à l'extérieur de l'articulation). Elle peut apparaître lorsque l'axe des genoux n'est pas exactement horizontal.