Les cônes fructifères femelles ou galbules sont traditionnellement utilisés dans l’insuffisance veineuse par voie orale ou en usage externe en vue de diminuer les sensations de jambes lourdes ou les troubles hémorroïdaires. D’après les travaux en pharmacologie, les extraits de cyprès sont aussi indiqués dans les affections hivernales.

Le cyprès est dispensé en pharmacie et les cônes femelles sont inscrits à la Pharmacopée française et disposent d’une monographie analytique de contrôle.