Alors que la marge commerciale est calculée sur le différentiel entre le prix de vente et le prix d’achat, la marge brute globale intègre la marge commerciale, les contrats de coopération commerciale, dont commissions des génériqueurs (2 à 2,5 % du chiffre d'affaires), les prestations de services (le MAD par exemple), les honoraires, ainsi que les nouvelles rémunérations (acte vaccinal depuis 2019, bilan partagé de médication…).